Delist.ru

Молекулярно-генетические маркеры риска генерализованного пародонтита и их применение в диагностике (07.09.2007)

Автор: Николаева Елена Николаевна

Относительная частота выявления “протективной” специфичности DRB1* 01 у пациентов 2-й группы (11 %) была меньше, чем у здоровых людей (29 %) более, чем в два раза, а у пациентов 1-й группы (4,3 %) – в 6,7 раза (р = 0,0001, pcor = 0,0013). Положительные ассоциации специфичности DRB1* 04 с клиническими проявлениями пародонтита были выявлены только у пациентов 1-й группы. Так, частота выявления этой специфичности у людей со здоровым пародонтом составляла 7 %, у пациентов, не инфицированных ГВ ? 12 %, а у пациентов с идентифицированными вирусами – 31 % (pcor = 0,012). Разница частот выявления других специфичностей локуса DRB1 у пациентов обследованных групп была статистически не достоверной.

Увеличение частоты аллеля DQA1 *0301 у пациентов с ХГП было обусловлено в большей степени с частотой его определения у пациентов 1-й группы (31,4 %), чем у пациентов 2-й группы (17,7 %), по сравнению со здоровыми людьми (11 %). Разница частот выявления аллеля DQA1 *0301 у пациентов обследованных групп была статистически достоверной (р = 0,03, RR = 2,13, ДИ: 1,12; 3,6). Ни у одного пациента 1-й группы не был выявлен аллель DQA1 *0401, в тоже время у пациентов 2-й группы его выявили с частотой 5,5 %, р = 0,08. Статистически достоверные различия в частоте аллелей локуса HLA - DQB1 у пациентов разных групп не были выявлены, хотя и была установлена тенденция увеличения частоты аллеля DQB1 *0302 у пациентов 1-й группы (22,8 %) по сравнению с пациентами 2-й группы (9,7 %), р = 0,017, pcor = 0,204. Частота аллеля DQB1 *0501 у пациентов 1-й группы составила 5,7 %, у представителей контрольной группы – 21,3 %, а у пациентов 2-й группы – 17 %, то есть была, соответственно ниже в 3,7 раза (р = 0,019, pcor = 0,220) и 3 раза (р = 0,03, pcor = 0,36).

Таким образом, из полученных нами результатов следует, что специфичность HLA-DRB1 *04 и аллель DQA1 *0301 могут являться “маркерами риска” ХГП, ассоциированного с вирусами семейства Herpesviridae, а “протективными” свойствами, обладают специфичность HLA-DRB1 *01, аллель локуса DQA1 *0501 и DQB1 *0501. В связи с этим, можно предположить, что выявленные ассоциации специфичности DRB1*04 с ХГП, возможно, связаны с доклиническими проявлениями аутоиммунных процессов, индуцированных вирусами.

Чтобы обосновать критерии определения микробиологических и иммуногенетических индикаторов риска генерализованного пародонтита, необходимых для оптимизации диагностики и прогнозирования характера течения воспалительных заболеваний пародонта, мы провели исследования с помощью методов статистического моделирования. С этой целью мы выделили предикторы – переменные, на основе которых можно было бы предсказывать интересующие нас признаки, в частности, глубину пародонтального кармана (ПК) или степень тяжести пародонтита. В первоначальный список предикторов включили 20 микробиологических и иммуногенетических показателей, имеющих наиболее высокие значения при пародонтите (оценены с помощью критерия хи - квадрат и ОШ), возможно, влияющих на изменение глубины ПК и клинический диагноз. Для этих признаков была вычислена корреляционная матрица, из которой следовало, что многие из предикоторов значимо коррелировали между собой, особенно бактерии с бактериями и генетические показатели с генетическими. Так, были выявлены корреляционные связи каждого вида пародонтопатогенов с десятью - двенадцатью, а P. gingivalis – со всеми показателями. С вирусами коррелировали пять - семь показателей, с иммуногенетическими признаками – восемь - пятнадцать показателей. Чтобы избежать неустойчивости результатов мы агрегировали предикторы с помощью метода главных компонент и факторного анализа, которые позволяют большое число переменных свести к меньшему количеству независимых влияющих величин, называемых факторами. При этом в один фактор объединяются переменные, сильно коррелирующие между собой. Переменные из разных факторов слабо коррелируют между собой.

После применения метода главных компонент и вращения факторов были выделены 4 общих фактора, которые могли бы объяснить связи между наблюдаемыми признаками. Были введены 4 новые переменные: 1. –“Бактерии”, 2. – “Предрасп.”, 3. – “Протект.”, 4. – “Вирусы”, которым присвоили коды от 0 (при отсутствии признака) до 3 (при наличии всех признаков).

Для изучения взаимосвязи глубины пародонтального кармана и определенных выше факторов использовали модель линейной регрессии, которую рассчитывали исходя из того, что глубина пародонтального кармана (ПК) является откликом, а “Бактерии”, “Вирусы”, “Протект.”, “Предрасп.” – предикторами агрегированных переменных. Статистический анализ показал, что рассчитанная регрессия являлась значимой на уровне 0,001. При этом все предикторы также были значимыми на уровне 5 %.

На основе стандартизированных коэффициентов (бета), указывающих на важность независимых переменных, вовлеченных в регрессионное уравнение, было сделано заключение, что три фактора – “Бактерии”, “Вирусы” и “Предрасп” (гены, ассоциированные с пародонтитом) значимо связаны с увеличением глубины пародонтального кармана. При этом сильнее всего на этот показатель влиял предиктор “Бактерии”, несколько менее – предиктор “Вирусы” и еще меньше – фактор “Предрасп”. Отрицательные регрессионные коэффициенты фактора “Протект” – 0,162 (В) и - 0,134 (бета) свидетельствовали о том, что данный фактор может способствовать уменьшению глубины пародонтального кармана (табл. 2).

Таблица 2

Коэффициенты линейной регрессии зависимой переменной – глубины

пародонтального кармана

Модель Нестандартизи-рованные коэффициенты Стандартизи-рованные коэффициенты

В стандартная ошибка бета t значимость

1 (константа) 3,040 0,239

12,454 0,000

Бактерии 0,848 0,145 0,392 5,863 0,000

Вирусы 0,935 0,235 0,264 3,976 0,000

Протект - 0,162 0,083 - 0,134 - 1,949 0,033

Предрасп 0,243 0,090 0,182 2,701 0,008

Таким образом, на основании проведенного анализа мы пришли к выводу, что линейная регрессионная модель:

ПК (мм) = 3,04 + 0,848*Бакт. + 0,935*Вирусы - 0,162*Протект. + 0,243*Предрасп.

достаточно хорошо описывает зависимость отклика ПК от предикторов, поэтому с ее помощью можно рассчитать предполагаемую глубину пародонтального кармана (в мм) в участке обследования.

С целью изучения зависимости степени тяжести заболевания (“Диагноз”) от агрегированных предикторов мы использовали модель полиномиальной логистической регрессии с упорядоченным откликом (ordinal regression): “Диагноз” – отклик, а “Бактерии”, “Вирусы”, “Протект.”, “Предрасп.” – предикторы. В качестве предикторов использовали микробиологические и иммуногенетические показатели 160 пациентов с ХГП. Приближение регрессионной модели оценивали при помощи функции максимального правдоподобия, которая оказалась статистически значимой на уровне 0,001.

Отклик “Диагноз” принимал следующие значения: 0 – здоровый пародонт (контрольная группа), 1 – легкая степень заболевания, 2 – средняя степень заболевания, 3 – тяжелая степень заболевания. Были рассчитаны оценки параметров регрессии (табл. 3). Каждой категории зависимых переменных и каждой категории факторов сопоставлена оценка параметра регрессии, причём оценки для соответствующих категорий высших порядков являются дублирующими и поэтому приравнены к нулю. Оценки параметров регрессии для зависимой переменной являются пороговыми оценками, которые для факторов называются оценками положения. Оценки положения дают возможность толковать влияние факторов и указывают на степень этого влияния. Было показано, что значимое на уровне 5 % влияние оказывали следующие предикторы: “Бактерии” на уровне 0, “Вирусы” на уровнях 0 и 1, “Протект” на уровне 1, “Предрасп” на уровнях 0, 1, 2. Поэтому все данные показатели мы могли использовать при дальнейших расчетах. При этом знак оценки регрессионного коэффициента предиктора “Протект” отличался от знака остальных, значимо отличных от нуля, оценок коэффициентов. Это могло свидетельствовать о том, что наличие у человека данного признака может препятствовать развитию пародонтита.

Значения предсказанной степени тяжести заболевания и вероятности прогноза для всех 160 случаев были внесены в исходную базу данных, и на их основе была вычислена таблица сопряженности признаков прогнозируемых и наблюдаемых категорий диагноза. Категория 0 (здоровый пародонт) была правильно предсказана в 47 из 51 (92 %) случаев, но в 4 (8 %) случаях люди со здоровым пародонтом были отнесены в группу пациентов со средней степенью тяжести ХГП. Легкая степень заболевания (категория 1) была правильно диагностирована в 10 из 18 (55,5 %) случаев, 3 (17 %) человека были отнесены ко здоровым людям, 2 (11 %) пациентам был поставлен неправильный диагноз ХГП средней степени и 3 (44 %) – ХГП тяжелой степени. Категория 2 (средняя степень заболевания) была правильно предсказана в 24 (54,5 %) случаев, 8 (18 %) человек были отнесены к здоровым, а 12 (27 %)

Таблица 3.

Оценки параметров регрессии

Оценки

регрессионных коэффициен-тов Ст. Ош. Статис-тика Вальда df Зна-чимо-сть 95 % доверительный

интервал

предел Верх-ний

Порог Диагноз = 0,00 - 25,700 1,596 259,364 1 0,000 - 28,836 - 22,579

Диагноз = 1,00 - 25,309 1,589 259,723 1 0,000 - 28,424 - 22,195

Диагноз = 2,00 - 23,383 1,542 229,933 1 0,000 - 26,406 - 20,361

Положение Бактерии = 0,00 - 2,459 0,661 13,818 1 0,000 - 3,755 - 1,162

Бактерии = 1,00 0,074 0,707 0,011 1 0,916 - 1,311 1,460

Бактерии = 2,00 - 0,409 0,829 0,244 1 0,621 - 2,033 1,214

Бактерии = 3,00 0а

Вирусы = 0,00 - 22,557 1,319 292,407 1 0,000 - 25,142 - 19,972

Вирусы = 1,00 - 21,656 1,353 256,214 1 0,000 - 24,307 - 19,004

Вирусы = 2,00 - 19,859 0,000

загрузка...